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人类基因“会说话”,体内微生物DNA也值得探寻,hcode要研究极微世界

转载时间:2021.08.20(原文发布时间:2015.07.31)
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你有没有想过自己的身体其实是一个小星球,里面生活着数万亿的微生物,它们的数量是细胞数量的10倍,拥有超过人类上百倍的基因。正是它们在我们体内分工执行着不同功能,如消化食物和维生素合成、情绪和行为影响等,更重要的是它们直接关系到我们的肠道健康、个体发育甚至导致代谢紊乱(例如,肥胖,糖尿病等)。这群“磨人的小妖精”正在逐步改变我们对健康和疾病的理解,你难道不想了解它们?

hcode是一家聚焦微生物大数据的互联网生物技术公司,运用基因技术、分子生物学技术、微生物学技术,通过大众科学(Citizen Science)、微生物社交以及生物创客建立微生物社区,帮助大家理解身体表面或体内微生物,致力于人体微生物与人类健康关系的探索。

公司产品研发已经完成,即将于8月初上市

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用户体验与其他基因检测产品类似。用户在官网购买服务后收到自主取样套装,首先登陆网站,完成样品注册,然后选择方便取样的时间和地点,按照采样手册完成采样,最后放入回寄袋联系指定快递寄回。

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不同之处是公司现在产品主要针对肠道微生物检测,所以样本为排泄物,而不是人体基因检测所需的唾液样本。后期公司将逐步推出人体不同区域的微生物解密产品。

由于科学研究、临床应用表明,肠道微生态的调节、干预和治疗方法在健康管理、健康改善、疾病治疗领域都有很大的作用,所以它将会成为健康状态的新指示灯,从而通过产品所得数据对研究有着重要的意义。

比如公司通过现有100左右样本数据发现那种平时胡吃海喝从不忌口的人,其体重却不见长的原因有可能是肠道菌群中拟杆菌门的比例较高,而那些喝凉水都胖的人,同样的菌种在其体内的比例就可能会很低。

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高通量测序和分析技术的普及和应用,实现直接对人体所有的微生物进行分析,使得全面了解人体内微生物菌群成为可能。公司收到样品后,以人类微生物组计划(HMP)为标准,采用Illumina测序设备和16S测序与分析方法提取微生物DNA。

接下来就是对测序结果进行数据分析。首先进行数据预处理,组装后再经过筛选、去重等步骤筛选得到目的片段,利用聚类方法分析目的片段彼此间的关系,与数据库比对后进行分类和注释获知菌种的丰度信息和多样性结果,在此基础上利用数理模型和数据统计、挖掘策略,提供与用户可交互和展示的结果数据。

结果出来以后,hcode会给用户一个反馈报告,用户可以通过PC和微信端查看结果。首先你可以了解到自身微生物组成和相对含量;其次通过一段时间的跟踪测序和分析,可以了解它们是如何变化的,以及生活方式对它们有怎样的影响;最后用户可以选择与不同的生活习惯、不同健康状态的人群比较,为自己的小宇宙找到坐标,也可以和密友分享结果,看看是否真的是“臭味相投”。

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产品初期,公司计划通过课题《胖or瘦,微生物有权发言》、《微生物怎样影响我们的饮食偏好》、《吃辣对我们的肠道微生物有什么样的影响》等来吸引感兴趣的小伙伴,形成微生物社群。公司也会通过微信公众号发布组织社群活动、分享有趣结论、研究进展等信息。

公司联合创始人兼CEO胡鹏表示,公司最终的目的是通过采集更多的样本来构建人体微生物数据中心和研究中心,同全球专家、学者、研究机构以及企业合作,解密微生物与健康和疾病之间的关系,实现向科研的转化,并将研究成果转化成有用的终端产品帮助人类解决健康或疾病问题。公司可以为特定科研目的的机构开放数据,筛选提取对应样本,节省时间,减少成本。

未来公司将向3个方面突破。首先公司通过吸引海外人才回国,聘请微生物专家作为顾问,同时完善算法,提升自身技术实力。

其次筹建自己的临床标准实验室,对基础数据进行临床研究,采用美国临床标准标准化衡量数据可信度。

最后公司积极倡导大众科学,目的是让每个人都能够探索和发现自身的微生物群,促进人们更好地理解微生物群来改善健康状态和生活方式,后期会建立小的实验空间,鼓励创客们参与到实验中,一起研究、探索、玩转微生物。

团队启动资金来自创始团队。

此前,36氪报道过生物科技初创 Ginkgo Bioworks 主要通过基因改造甚至定制微生物的方式合成气味,并制作香精。美国投资者现也把微生物信息公司看为重点投资领域,或许下一个改变世界的技术就是微生物检测?

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