36氪获悉,基因组医学公司「路胜生物」(Lucence)今日宣布发售全球首个用于直接检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚基因组RNA(sgRNA)试剂盒DeepMARK™。DeepMARK™二代测序试剂盒利用基于扩增子的新一代测序(NGS)技术,可在一次测序中同时解析新型冠状病毒基因组和亚基因组RNA,帮助科学家们快速追踪感染溯源,确定病毒传染性,及指导疫苗研发。
「路胜生物」全称路胜生物科技(苏州)有限公司,是新加坡精准医疗公司Lucence在中国的子公司,通过自主研发的高通量测序技术,为精准医疗行业提供研究服务,数据分析以及整体解决方案。公司总部位于新加坡,在苏州、加利福尼亚和香港设有办事处。此外,「路胜生物」还设有获得CAP, CLIA权威资质认证的中心实验室。
DeepMARK™二代测序试剂盒
从原理上讲,新冠病毒的sgRNA是科研人员认可的与传染性相关的活性病毒复制的标志物,sgRNA作为病毒复制的标志物也是公认的评估疫苗效果的方法。然而病毒培养存在耗时长,成本高的问题,DeepMARK™利用公司专利的超灵敏二代测序(NGS)技术AmpliMARK™,可以大幅缩短分析临床样本的时间,且工作流程简单,安全高效。
DeepMARK™试剂盒还采用了基因指纹识别技术,鉴别病毒传播路径、病毒簇和病毒传染性,以便公共卫生中心快速应对疫情爆发。新加坡国立大学苏瑞福公共卫生学院的副院长Hsu Li Yang也表示:“基因指纹分析技术可以更快,更深入地分析病毒传播。该技术帮助我们更加全面了解SARS-CoV-2,并有助于持续对抗COVID-19。”
利用以上技术,DeepMARK™可以实现全基因组覆盖,消除常规的测序错误;检测低病毒载量样本,减少假阴性,能对RT-PCR假阴性样本进行二次检测、复核确诊;快速鉴定单倍型和病毒株,追溯病毒来源;无需耗时的病毒培养,即可鉴定sgRNA转录组基因突变是否会导致病毒变异,适用于指导疫苗和新药研发。此外,该产品还可以同时检测无症状患者和康复患者是否具有传染性。
DeepMARK™ pipeline平台
最后,「路胜生物」还为DeepMARK™开发了pipeline平台,通过将测序数据上传到AI生物分析平台,可实现病毒基因组测序结果的自动化分析,例如系统学分析,并将多种数据可视化。现阶段DeepMARK™适用于illumina平台,未来会推出基于华大智造(MGI)的版本。
注:DeepMARK™试剂盒仅供科学研究使用,不用于临床诊断。
编辑:蔡姝凝