第三代基因测序实现临床转化，「贝瑞基因」推出地中海贫血筛查产品

地中海贫血（Thalassemia)，简称地贫，作为我国南部一些省份高发遗传性疾病，目前临床上尚无经济有效的治疗手段，很多家庭因病致贫、因病返贫。

针对这些问题，第三代基因测序技术能加以解决：精准全面地通过夫妻双方携带者筛查，提前预判重型地贫生育风险。

8月24日，贝瑞基因（000710）正式对外宣布了公司第三代基因测序技术（简称三代测序）向临床转化的最新成果：运用第三代基因测序技术进行地中海贫血携带者筛查产品。

据贝瑞基因三代测序事业部总监任志林介绍，公司提供的三代地贫，基于 PacBio Sequel II三代测序平台，能够打破常规地贫的筛查局限，达到覆盖全面、极致精准、一次到位的效果。“检测非常简便，仅需采集1微升全血样本，无需DNA提取和打断。还有就是准确度方面，大于99.9%。”

其实，贝瑞基因较早就开展了生育健康业务，是国内NIPT龙头之一，目前已经布局了孕前、孕期、新生儿的三级预防。在遗传病检测领域，贝瑞基因以WES和CNV-seq技术为核心，为临床提供多种检测组合方案，在儿童及成年阶段的遗传病检测中发挥重要作用。

贝瑞基因北京总部（企业供图）

如今，贝瑞基因围绕第三代测序技术展开应用探索，以三代地贫为切入口实现了产品化。 

据悉，三代测序读长可达到二代测序的100倍以上，相较于传统PCR和NGS，在临床应用上优势明显，如检测简便、全面精准等。而对于三代测序的价格成本和可及性，方舟投资（ARK Invest）年初预测，相较二代测序，三代测序有更高的准确性、更全面的变异检测和更丰富的功能，或将以较快的速度获得市场份额。

方舟投资也预测，到2025年底，三代测序对整个人类基因组测序的成本将下降到100—200美元，和二代测序几乎实现成本平价。同时，三代测序所带来的营收或将以每年82%的速度增长，从2020年的2.5亿美元增长到2025年的50亿美元左右。 

其实，贝瑞基因早已开始着手布局三代测序。尽管已成功开发多项以二代测序为基础的临床基因检测平台、试剂和服务，并实现了规模化临床应用，但多年临床转化实践让贝瑞基因认识到，仍有一些重大疾病的筛查不在二代测序的检测范围内，三代测序是大势所趋。

为此，2019年，贝瑞基因与全球领先的第三代测序仪研发和制造企业Pacific Biosciences达成长期合作，联合开发基于PacBio SMRT®测序技术的基因检测平台，加速为中国临床和科研提供相应的测序解决方案。 

第三代测序仪（企业供图）

在进行三代测序研发的同时，究竟选择怎样的突破口实现产品落地？经过诸多临床研究的论证，三代地贫成为了答案，除了因为地中海贫血症发病率高、人群众多外，还有如下研究进一步佐证： 

• 2021年7月，由贝瑞基因主导，中南大学医学遗传学研究中心联合湖南家辉遗传病专科医院等南方地贫高发省份的12家权威医院，在分子诊断权威期刊《The Journal of Molecular Diagnostics》上发表了三代地贫多中心临床前瞻性研究成果。研究共纳入1759例血常规或血红蛋白检测阳性的临床前瞻性样本，双盲检测，联合Sanger测序、Gap-PCR等多种“金标准”方法验证，研究证实三代地贫检测准确性为100%。

• 之前，2020 年，贝瑞基因与福建省妇幼合作在《The Journal of Molecular Diagnostics》发表重要回顾性研究，证实三代地贫可作为大规模精准地贫携带者筛查的方法应用于临床。

• 此外，今年1—6月，贝瑞基因发起了地中海贫血基因图谱（TiGA）计划，与南方13个地贫高发省市（包括香港特别行政区）的42家地贫防控权威医院合作，纳入近5000例临床疑难样本进行三代地贫检测。相较于传统PCR、NGS、MLPA等联合应用，三代地贫仍可将罕见型α地贫和β地贫的基因诊断率分别提升约40%和60%。

据介绍，贝瑞基因在三代测序临床研究和应用上思路比较明确——以单病检测实现产品化落地，并不断优化升级，产品迭代。

目前，根据临床需求和具体场景，贝瑞基因针对性推出三款地贫产品，包括三代地贫携带者筛查、新生儿筛查及全面诊断。值得一提的是，因为三代技术的准确度高、成本可及，贝瑞基因也在积极推进其他疾病检测的应用，最新研发的三代CAH（先天性肾上腺皮质增生症）新产品也即将上市。 

贝瑞基因董事长高扬表示，“相信作为三代测序在临床应用场景的突破口之一，三代地贫只是一个开始，未来三代测序仪在探寻基因疾病以及人类全基因数据读取方面的应用，将有巨大的潜力和广阔的应用空间。”